El Museo de Alcalá, además de una extensa programación durante todo el año, lleva a cabo una labor más allá de la tradicional difusión de los contenidos culturales. Las exposiciones permanentes y temporales son solo la punta del iceberg de la ingente tarea que realiza el equipo técnico, dirigido por Francisco Mantecón, al frente de la institución museística desde su inauguración en 2005. El Museo es un ente vivo que se alimenta de una gran cantidad de elementos artísticos y patrimoniales. A la difusión, se suman la catalogación, la investigación y la conservación del patrimonio cultural que alberga en sus salas y almacenes. Unos trabajos que en la mayoría de los casos pasan desapercibidos para los usuarios del Museo, incluso para los más habituales.